肛周脓肿一旦诊断明确，需要尽早手术。中医可针对患者不同辨证分型，以及疾病不同阶段进行辨证施治。一般在没有成脓阶段以消为主，通过清热解毒、软坚散结药物使脓肿尽快消散。脓肿形成阶段，则通过脱法，包括补脱法、透脱法，使脓液尽早排出，达到缓解症状治疗作用。在后期以补为主，通过补益气血，促进局部升级，尽早愈合。
中医外治法在肛周脓肿治疗中起到举足轻重的作用，临床没有成脓阶段就诊患者通常很少。门诊患者多数属于已经形成脓肿或脓肿破溃阶段，建议尽早手术治疗。通常手术包括单纯切开引流和根治性脓肿手术，对于位置较低的表浅肛周脓肿，一般进行一次性根治手术。位置较高的复杂脓肿，为保证肛门括约肌功能，一般先切开引流，待瘘管形成、脓腔缩小以后再进行根治手术。肛周脓肿疾病比较常见，经过积极治疗完全可以治愈。
