甲亢一般指甲状腺功能亢进症，其内科治疗方法主要包括使用抗甲状腺药物以及碘-131治疗。抗甲状腺药物目前临床上有2大类，分别是硫脲类和咪唑类。硫脲类包括甲基硫氧嘧啶与丙基硫氧嘧啶，咪唑类主要是甲巯咪唑，两药相比各有利弊。

丙基硫氧嘧啶半衰期短，因此1日需要分多次服药，但是可以抑制外周组织中T4向T3转化，控制甲亢症状比较迅速。而甲巯咪唑半衰期长，每日只需要服药1次，肝脏毒性比丙基硫氧嘧啶小，因此需根据患者甲亢的实际情况及合并症情况选择药物。一般药物治疗的疗程是12-18个月，在停药1年后进行复查。如果停药1年后患者甲亢症状消失，甲状腺激素水平和促甲状腺激素水平处于正常范围内，称为甲亢缓解。

服用抗甲状腺药物可能会出现并发症，最常见的是粒细胞缺乏，即引起患者白细胞以及中性粒细胞下降。如果患者中性粒细胞＞1.5×10^9/L，只需减量抗甲状腺药物即可。如果患者中性粒细胞下降到1.5×10^9/L以下，达到粒细胞缺乏状态，需要停用抗甲状腺药物。其他少见的不良反应还包括皮疹、血管炎以及肝功能损害。除抗甲状腺药物外，还可以进行碘-131治疗，常见并发症是甲状腺功能减退。