甲状腺恶性肿瘤治疗前需区分病理类型，乳头状癌、滤泡状癌首选手术治疗。未分化癌转移概率较大，手术治疗需谨慎。甲状腺恶性肿瘤如能进行手术治疗，首选手术治疗。

其它恶性肿瘤可选择内分泌治疗、靶向治疗。甲状腺癌治疗手段比较单一，进行甲状腺次全切后，甲状腺素补充为内分泌治疗手段，术后可服用甲状腺素片。甲状腺不存在放疗、化疗可能性，但碘-131治疗较重要。接受碘-131治疗指征为肿块偏大、术中切缘不明确，可能为阳性或淋巴结转移较多者。