半夜小腹痛导致痛醒常与痉挛性疼痛相关，尤其输尿管、膀胱结石患者常于半夜引起局部疼痛，可明显影响睡眠状态。由于患者在疼痛前处于安静、静止状态，并且没有明显外击和损伤，因此疼痛大多不是来自于局部具体病变，如不与肿瘤性肠扭转或肠套叠、肠穿孔等严重外科急腹症有关。

组织器官内出现痉挛性因素，如泌尿系、膀胱结石等可刺激输尿管、膀胱形成局部痉挛，进而产生较明显疼痛感。出现下腹或小腹疼痛，尤其半夜突然出现疼痛，应考虑为泌尿系结石引起的局部疼痛。应通过超声、尿常规检查明确是否存在输尿管、肾盂扩张，甚至有时可直接发现结石而明确诊断。