脚心上长小疙瘩的原因如下：

1、常见的一种情况是脚上长瘊子，即寻常疣，脚心会长角化性、菜花状的硬的小疙瘩，由病毒感染引起，治疗方面主要采用冷冻法；

2、脚心长疙瘩如果是红色、伴有瘙痒，可能是脚部的湿疹，与长在其它部位的红斑、丘疹、瘙痒一样。湿疹的治疗使用抗过敏的药、激素药膏来对症治疗；

3、真菌感染也可以表现为脚心上长小疙瘩，应为红色，可能伴随一些水泡、红斑、脱屑，出现瘙痒感，要用抗真菌的药来治疗。