小孩子眼睛疼的原因，可能包括屈光不正、倒睫及鼻窦炎等，具体原因及治疗如下：

1、屈光不正：一般小孩在2-6岁，视力正在发育的过程当中，大脑有个适应过程。所以此时孩子一般都是生理性远视，有时大脑在适应生理性远视的过程当中，就觉得有点不适，看东西有酸痛感。并无治疗的必要，最主要是常规到眼科做检查，判断远视值不值得治疗。有时远视若偏高，看电脑电视时间长出现酸痛，也是正常现象；

2、倒睫：倒睫会把角膜刮伤，刮伤时就会怕光、刺痛，有流泪的感觉。医生如果评估确实较严重，到了需要治疗的程度，必要时进行手术，修剪部分皮肤，眼睛痛就会明显得到好转；

3、鼻窦炎：为最常见原因。鼻窦炎时小孩有眼窝周围的胀痛，无法讲清位置。另外小孩觉得眼睛疼，实际上不一定是眼睛疼，有可能是鼻窦炎造成。如果出现眼睛疼还有头疼，且本身有鼻炎，多数情况下，还是跟鼻窦炎有关。重点还是治鼻炎和鼻窦炎，到耳鼻喉科找相应的医生和专家进行治疗。