大多数情况下，结核菌即结核杆菌可以终身携带。结核杆菌是细胞内寄生的细菌，因此抗结核药很难能把身体内细胞的结核杆菌完全清除掉。结核杆菌可以潜伏在人体的细胞内，甚至肺结核病人治愈以后，可以潜伏在肺部钙化灶内，一旦免疫力低下时，潜伏在人体的结核菌会重新繁殖，导致结核病的复发。引起结核菌复发的常见的原因有以下几种情况：

1、感染：可导致免疫机体的功能低下或者缺失，常见的是艾滋病病人，免疫机能受到破坏，容易感染结核杆菌，很难能得到完全的治愈，容易复发。

2、非感染：如长期服用糖皮质激素，或者放化疗的病人。并且风湿免疫性疾病的病人，因为长期需要使用免疫抑制剂，也容易导致结核菌复阳。