他克莫司和环孢素都属于免疫抑制类药物，且为同一类免疫制剂，即钙调磷酸酶抑制剂，所以作用机制基本相似，主要区别具体如下：

1、免疫抑制效果：他克莫司免疫抑制效果强于环孢素；

2、不良反应：他克莫司和环孢素相比，不良反应类别会有差异。他克莫司易引起代谢方面的不良反应，可引发高脂血症、高尿酸血症、肝功能异常。而环孢素常见的不良反应会引发肾毒性、肝脏毒性，也可能导致齿龈增生、多毛，但齿龈增生、多毛不是他克莫司等常见副作用。

使用他克莫司或者环孢素时，需注意免疫抑制药物具有较大副作用，且存在较大个体差异，建议遵照医嘱推荐的用法用量服用，用药期间应注意对相关指标监测，患者具体适合的药物类型需遵照医嘱建议。