神经内镜治疗脑积水有一定的适应症，并不是所有的脑积水都要通过神经内镜进行治疗。梗阻性脑积水做神经内镜，把梗阻的地方重新又给开通，或者重新开通另外一条路，其治疗效果不错。如果患者排除梗阻性，则是交通性脑积水，因出血、或者创伤、感染后导致整个脑积液吸收能力发生障碍。交互性的脑积水，即使做内镜重新开其它通路，对脑积水缓解程度不是很好，多数还是要给病人做传统脑室腹腔分流手术。
内镜治疗脑积水需要选择适应症，要进行很多术前评估，给病人查核磁，要根据脑积液在脑内、中枢神经系统循环的情况如何，有无出现流速减慢或者增快、涡流、梗阻的地方。如果梗阻性评估后，需要做三脑室底造瘘术的内镜术，其效果较好。