新生儿眼睛有眼屎，最多见的应该是结膜炎，新生儿在经过产道时，可能母亲泌尿生殖系统的细菌污染引起结膜炎，此时需要去眼科做及时治疗，应该局部用药，因为结膜炎有多种感染，有可能是细菌感染也可能是支原体感染或者是衣原体感染，不同的感染可能需要做不同治疗，所以还是建议去眼科治疗。
经过治疗以后隔一段时间又复发，这种反复的结膜炎要注意合并泪囊炎、鼻泪管炎，建议还是让专业医生指导，除了点眼药可能还需要做泪囊、鼻泪管处按摩治疗，如果是反复结膜炎，建议去眼科做鼻泪管再通术。