腹痛伴有肛门坠痛的主要原因有以下几种：

1、植物神经功能紊乱：可以服用调节胃肠道植物神经紊乱的药物，比如得舒特(匹维溴铵片)、援生力维(马来酸曲美布汀片)等，可能会缓解症状；

2、直肠病变：如果上述药物不缓解症状，可能需要到医院的结直肠外科、结直肠肛门外科或肛肠外科检查，是否有直肠病变，如果有直肠肿瘤，比如直肠癌、直肠腺瘤、直肠炎，这些疾病都会引起腹痛和肛门坠痛，这时还需要做结肠镜观察，因为直肠病变会反射到腹部形成腹痛，还会有肛门坠痛感；

3、其他病变：比如盆腔肿瘤、直肠周围的病变，也有可能会引起腹痛和肛门坠痛，男性的前列腺、精囊腺病变，女性的阴道、宫颈、子宫病变，可能都会引起腹痛和肛门坠痛。