新生儿肺炎在初期，表现为低热，甚至不发烧。咳嗽症状并不明显，多以吐沫为主。严重的患儿出现三凹征，即鼻煽、锁骨上窝、胁部三个凹陷。或者昏迷、嗜睡，烦躁、哭闹，更严重的病例表现惊厥、抽搐。如患儿发生重症感染，也可出现败血症，甚至化脓性脑炎。