医源性输尿管损伤的治疗多以手术为主，再手术相较原发病手术更复杂，如妇科的子宫切除术，可能在术中损伤输尿管，处理需把原来闭合的创口重新打开，在瘢痕里面重新找到输尿管，再去掉病变段，重新连接；还有腔内的手术方法，即通过腹腔镜或输尿管镜、经皮肾镜等解决输尿管的再通问题。