肢端肥大症需与垂体瘤以及异位分泌生长激素的其它系统肿瘤相鉴别。具体鉴别方法如下：

1、垂体生长激素腺瘤：通过垂体磁共振即可明确诊断；

2、分泌生长激素的异位肿瘤：可生长在腹部、胸腔，需用核素奥曲肽显像进行明确；

3、厚皮厚骨膜综合征：表现为头皮厚、易出褶，属于临床罕见遗传病，易误诊为肢端肥大症。通过生长激素、ogtt检查即可明确诊断。