肛瘘的检查方法一般有以下几种：

1、肛门指检：为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结；

2、美兰造影：将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘；

3、影像学检查：包括B超、磁共振、肛瘘造影；

4、手术探查：需在麻醉状态下进行。

目前为止任何检查都不能在手术前明确瘘道形状和与肌肉的位置关系。