单纯的惊厥不会留下后遗症，90%的热性惊厥5分钟内可自行停止，对患儿脑部及各脏器造成损伤的可能性较小。原发病较严重者可能会出现后遗症，若原发病仅为感冒、腹泻时出现后遗症的可能性较小。脑炎患儿中枢神经系统感染，有出现后遗症的可能，可能出现癫痫或智力、运动异常，或语言的落后及丧失。