扁平疣的治疗分为内治和外治，内治包括中药内服及西药治疗；外治的常规治疗方法主要包括激光、冷冻、火针及外用药的外涂。激光易留下疤痕，冷冻易导致复发、扩散，相比而言火针疗效相对最好，一般一个皮损只需做一次，两周左右结痂脱落，皮疹即可恢复。外治的同时还需内服和外敷中药，以减少病毒的扩散及复发。