咽喉囊肿通常用药物治疗无效，咽喉囊肿最典型的是会厌囊肿。会厌囊肿较小，通常病人没有任何临床症状，在查体的时候或者是在检查咽喉的时候，可以发现会厌有小的囊肿，这时候只是观察就可以。当会厌囊肿长大以后，逐渐出现临床症状，像出现了异物感。当会厌囊肿长到一定程度，会感觉到吞咽的时候有阻碍感，甚至会影响呼吸，造成呼吸困难。
这时临床上通常要采取手术治疗，手术一般在全麻支撑喉镜下，用射频或者激光或手术器械将会厌囊肿切除，切除以后主要是观察病人，第一个出血的情况，有少数人因为伤口是敞开的，如果口中有血或者是吐的都是血，要注意伤口有出血。第二个就是防止感染，要注意病人如果术后发烧明显，吞咽疼痛加剧，说明有感染，要用抗生素进行抗感染治疗，会厌囊肿手术以后，通常复发率不是很高。
