多数肝细胞腺瘤患者无明显症状。其临床症状与位置有关，肿瘤位置靠近包膜，可刺激、牵拉肝脏包膜，出现不适甚至疼痛症状。其症状与大小关系也较密切，肿瘤较大压迫胆管，影响肝脏功能，可出现黄疸或其他肝功能损伤，胆红素升高可致白睛发黄、大便颜色变白、皮肤黄染，转氨酶升高可引起患者消化道不适。肿瘤较小者不产生任何症状，称为亚临床期。