男生小腹痛的原因包括久不排精、结石、慢性前列腺炎，如下所示：

1、久不排精：常常由于久不排精导致精液在生殖道中淤积，当精液在输精管内压力较高时会出现小肚子胀痛症状，常常在排精后上述症状会明显缓解。男生在青春期后会出现精液现象，产生精液量较多时如不及时排精就会出现遗精现象。如长期没有发生遗精和排精现象时，就会在下腹部输精管走行区出现坠胀不适症状；

2、结石：男生发生输尿管下段结石时会出现小腹部绞痛或胀痛症状，当刺激膀胱时还会引起尿路刺激症状，男生会出现膀胱频繁收缩引起的尿频、尿急和尿痛症状；

3、慢性前列腺炎：由于长期手淫导致包皮、龟头反复发炎，当炎症刺激尿道口时会引起尿道口感染从而引起尿道炎，逆行感染后会引起前列腺炎。当前列腺发炎时会刺激膀胱颈部黏膜出现糜烂，就会出现下腹部疼痛症状。