小儿金黄色葡萄球菌的治疗方法，主要有以下几个方面：

1、对症治疗：金黄色葡萄球菌肺炎会导致小儿出现发热 、咳嗽、喘息等症状。小儿发热时可以选用药物进行降温，常用的退热药有布洛芬和对乙酰氨基酚，布洛芬适用于6个月以上的小儿，儿对乙酰氨基酚适用于3个月以上的小儿。并且在小儿1次发热病程中，尽量使用同一种退烧药，而且布洛芬和对乙酰氨基酚不能交替使用，以免增加药物的副作用。如果小儿出现咳嗽、喘息等症状时，可以选用止咳化痰、口服或者雾化吸入药物，必要时配合静脉输液药物进行治疗；

2、对因治疗：如果金黄色葡萄球菌肺炎导致小儿出现气胸、胸腔积液或者脓胸等，需进行胸腔闭式引流，帮助脓液、气胸或胸腔积液排出。对于非耐药的金黄色葡萄球菌可以选用苯唑西林、青霉素类、普通头孢类的药物进行抗感染治疗。如果为耐药的金黄色葡萄球菌，根据药敏选用万古霉素或者利赖唑胺等糖肽类的药物，进行抗金黄色葡萄球菌的治疗。