激光去疣体的疼痛程度可控，通常在采取相应的操作后可以达到无痛，而治疗所需时间从几秒钟到半分钟，到1分钟都有，具体需要根据疣体的大小、位置和深度等有所区分。
通常体表上的小疣体，5-10s即可去除单个疣体。激光去疣是用二氧化碳激光，对体表的疣状增生进行物理性烧灼、破坏，最后去除的过程，其过程是通过二氧化碳激光形成的物理性烧灼，如果对于正常皮肤，即没有进行处理的情况下来进行操作，会有疼痛的感觉。
因此可以在操作前给予治疗部位进行适当处理，比如敷表面麻醉膏或局部注射麻醉的溶液，从而达到疼痛缓解的情况。治疗过程的时间不是很长，但根据疣体大小分别会有时间的差异，通常时间均比较快，几秒钟即可结束，因此不用过于担心疼痛和治疗过程时间过长的情况。
