盐酸万古霉素主要具有抗菌作用，万古霉素属于糖肽类抗生素，对革兰氏阳性菌具有强大的抗菌作用，通常用于耐药菌的感染性疾病，主要用于耐药的革兰氏阳性菌，比如对耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌，具有很好的抗菌作用。

万古霉素的抗菌机制主要是通过抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥抗菌作用，还能改变细菌细胞膜的通透性，同时也能影响病原菌RNA的合成，起到抗菌作用。盐酸万古霉素主要用于感染性疾病的治疗，比如可以用于骨关节炎的治疗，用于菌血症、肺炎，还可以用于其他部位的感染，主要用于革兰氏阳性菌的感染。另外，万古霉素口服也可以用于难辨梭菌所导致的伪膜性肠炎。