川崎病住院期间的治疗主要是控制体温，监测患儿心脏的心血管损害情况，当这两项指标处于恢复期时，患儿就可以出院并继续出院后的治疗。川崎病患儿出院后的治疗时间较长，一般为2-3个月。因川崎病可引起心脏损害，如未经规范治疗，其危害较大。所以须严格遵从医嘱，在出院后15天、1个月、2个月、3个月、6个月、1年，定期随诊。1年之后，每年复查1次，连续5年，直至痊愈。