真菌感染引起的甲癣主要针对病原微生物采用抗真菌的药物治疗。无论是外用药物还是口服药物，都可以破坏真菌细胞的细胞壁、细胞膜，抑制生长，杀灭活性。

在真菌的治疗方面还需注意指甲生长问题，指甲生长较快，治疗效果就会较好，治愈率较高。老年人由于身体机能原因，指甲生长缓慢，疗程变长。灰指甲的治疗需在医生的指导下进行，治愈率能达到60%-80%。