手腕部腱鞘囊肿治疗，目前以手术治疗为最佳方案，因囊肿从深层发出，尚无其他方法解决该问题，无法根治该病。手术包括开放性手术、关节镜手术。

若患者囊肿较大，且通过保守治疗反复发作者，需手术治疗，或部分患者囊肿较大严重影响局部关节外形及功能，出现酸、胀、痛等不适感后，需尽快手术处理。如早期未引起重视进行处理，囊肿越大则损伤更大。