多囊肾的分期如下：

1、根据肾脏的功能分期：分为肾功能代偿期，患者肾功能稍减低，但肾脏可正常代偿；肾功能失代偿期，患者囊肿逐渐长大，肾脏已不能够正常代偿；尿毒症期，即多囊肾发展到了终末期肾病，出现尿毒症的相关症状；

2、根据肾脏的形态分期：早期，囊肿较小、数量较少；晚期囊肿较大、数量较多，伴随着肾功能下降。