卵巢囊肿是否会影响月经不能一概而论，与囊肿性质密切有关。一般来说，由于排卵引起的生理性囊肿，月经干净后可自行吸收，不会影响月经；由于子宫内膜异位引起的囊肿，可能造成月经失调、进行性痛经，严重者甚至影响排卵和生育。因此，一旦发现卵巢囊肿，应定期进行B超检查，了解其增长趋势，以便及早治疗，避免造成严重后果。