不同类型的先天性心脏病治疗的手术也不同，常见的非紫绀型先心病手术治疗费用约为3万元；比较复杂的紫绀型先心病手术治疗费用约为5万元，更为复杂的心血管畸形手术治疗费用更高。部分地区享有城居医保的先心病患儿可以报销60%。本地户籍人口以及本人或父母在本地缴纳了一定年限社保的先心病患者可以享受完全免费的先心病外科手术治疗。此外部分地区政府、医院及红十字会还为先心病及其他心脏病患者提供诸多救助。