肠炎治疗不及时，会对肠黏膜产生较大的损害。长期的慢性肠炎，可导致肠道的狭窄、出血甚至肠道穿孔，严重者还可引起重度肠扩张。同时肠炎经久不愈，可能伴生肠息肉，肠息肉在一定条件下可发展为肠癌。此外，长期的肠炎，严重者可因腹痛、腹泻而影响其日常生活与工作。若患者有家族史，尤其是肠癌家族史，一般建议其直系亲属定期行肠镜检查，排除是否有肠息肉。