CT与磁共振，虽然图像比较类似，但成像原理、方法完全不同，检查时根据自身情况选择。CT通过组织对高能X射线吸收差异、密度差异，利用计算机成像获取图像。

磁共振是通过磁场、组织释放的氢原子振动从而获取的影像。CT与磁共振检查的侧重点有所不同，如肺部病变，利用CT检查优势较大，扫描速度快、图像清楚；磁共振检查肺部，由于肺部含有空气，水分子较少，共振氢离子少，成像模糊。