胃间质瘤起源于胃肠道未定向分化的间质细胞，属于一种恶性肿瘤，且随肿瘤体积增大核分裂象增加，恶性程度也相应增加。

胃间质瘤的治疗效果与其恶性程度密切相关，低度风险的胃间质瘤通过内镜下黏膜切除或者腹腔镜局部切除，可以完全治愈。

中、高度风险的胃间质瘤，则需要手术联合靶向治疗，以达到长期治愈；进展期胃间质瘤，五年生存率可超过50%。