食管肿瘤分为良性和恶性，良性肿瘤的病因如食管的平滑肌瘤，与肌肉的瘤样变有关。恶性肿瘤如食管癌的病因主要有吸烟、饮酒、长期食用过烫的食物、缺乏维生素及遗传因素等。吸烟、饮酒及过烫的食物均可损伤食管黏膜，维生素缺乏可使食管黏膜的修复能力下降。这些病因导致食管黏膜的慢性损伤和反复修复，在反复修复的过程中，细胞转变为癌细胞。