胸腺瘤的预后与它的分期有关。A型胸腺瘤经手术切除干净后，一般复发率较低，预后较好；AB型或B型胸腺瘤，已不是单纯的良性肿瘤，常处于良恶性的交界，或已经有恶性的情况，患者手术之后还需做进一步的放疗和化疗，预后较好，多数患者均可活到五年以上；C型的胸腺瘤比较倾向于癌，预后差，会出现恶病质改变，发生胸腺瘤的并发症，如重症肌无力等。