慢性结肠炎的病因如下：

1、功能性结肠炎：主要由于肠道对外界刺激过度敏感导致，如患者进食生冷的辣椒或冰镇食品。而患者的心理亦可造成胃肠道痉挛的症状，如患者的压力、紧张情绪、恐惧等；

2、器质性结肠炎：主要为溃疡性结肠炎，多见于克罗恩病，其主要原因与自身免疫力下降有关。其中，遗传及外部环境的影响，如长期紧张及压力均可导致免疫功能的紊乱，形成自身损害。