色素性青光眼是由虹膜结构异常所致，正常情况下虹膜的整体形态，呈现前突状态，或者稍微平坦，而色素性青光眼，虹膜呈现后凹状态，可与晶状体悬韧带摩擦。瞳孔、虹膜不断运动，光线明暗变化时，虹膜也会产生运动，运动过程中与悬韧带反复发生摩擦，脱失的色素颗粒不断聚集于房水循环中，达到一定聚集量可出现堵塞，房水通道堵塞可导致眼压升高，进而导致色素性青光眼。色素性青光眼与染色体有关，具有家族聚集性，此外，高度近视人群易发病。