头部核磁共振检查多数人会有不适，通常是因为该检查噪音巨大而造成，一般需佩戴耳塞，以减少对人体的影响。多数患者可顺利进行磁共振检查，少数胆小、紧张的患者恐惧磁共振检查，无法适应，可能与个人的心理素质有关，建议该类患者调整心态。

此外，造影剂过敏的发生率较小，可能为几十万分之一，且医疗机构一般具备相应的应急方案，如患者出现过敏现象，通常可获得及时治疗。