儿童乙流退烧后出现咳嗽，可以对症处理，例如口服止咳化痰的药物，必要的时候可以配合雾化吸入的药物化痰，例如雾化吸入乙酰半胱氨酸溶液、吸入性氨溴索溶液，进行化痰对症处理。通过治疗，如果症状逐渐缓解，说明治疗有效。
如果通过治疗症状没有缓解，甚至又出现其它症状，建议及时到医院复诊，进一步排除是否合并细菌或其它病原体检查，必要时可能需要完善炎症指标、痰培养、支原体、衣原体抗体等检查。如果明确有细菌感染，例如感染指标显著增高，痰培养有大量细菌生长，明确合并细菌感染，在对症处理的同时，需要加用敏感抗生素，进行足疗程的抗细菌感染治疗。如果完善支原体、衣原体检查，考虑合并有支原体、衣原体的感染，在对症处理的同时，需要加用阿奇霉素、红霉素、环酯红霉素等大环内酯类药物进行治疗。
