肛瘘的类型不同，治疗的难易程度不同。单纯性肛瘘解剖结构较清晰，诊断明确，一次性手术治疗，即可治愈；高位复杂性肛瘘治疗前需进行临床分期，即使分期明确，也不能确保一次性治愈。近年来随着肛瘘术式的改变，药物质量的提高，治疗效果也有明显提升，95%以上可经一次性手术治愈，5%的患者，因瘘管复杂，需2次或3次分期手术治疗，方可治愈。因此，对于肛瘘的治疗，应首先明确诊断，其次是及时治疗，避免反复发作，由单纯性肛瘘变为复杂性肛瘘。