卵圆孔未闭不属于遗传性疾病，虽然是先天性心脏疾病，但不会遗传，成人发病率较高可达到20%以上。在胎儿发育过程中，心房间隔逐渐生长、闭合，卵圆孔在胎儿阶段处于持续开放状态，胎儿在母体内无呼吸、肺部无血液循环，动脉血主要来源于脐带，肝脏静脉系统通过左右心房没有闭合的卵圆孔，进入动脉系统，从而向各个组织脏器供应动脉血。胎儿出生后，随着呼吸、哭泣，肺部开始工作，不再需要脐带供应动脉血，通过呼吸使血液富含氧气，此时心房间的卵圆孔将会闭合。

大部分卵圆孔未闭没有明显表现，少数患者会出现持续性头疼以及部分中青年不明原因的脑梗，最后确诊为卵圆孔未闭。如果开放孔径较大或时间较长，尤其是在剧烈的咳嗽、憋气后，如潜水，使卵圆孔重新开发，静脉血通过心房流入动脉系统而引起头疼。如果下肢静脉血栓，随着孔道开放，从静脉系统流入左心系统，可能导致脑梗及其他脏器栓塞。