继发孔型房间隔缺损5mm，要根据患者情况进行治疗，具体如下：

1、如果继发孔型房间隔缺损5mm发生在婴幼儿身上，这种情况往往不需要治疗，因为5mm的缺损对于孩子的影响往往比较小，可以选择观察，在观察的过程中，有一部分孩子可以出现房间隔缺损自愈的情况。因此，需要定期复查，如果房间隔缺损没有明显变化，可以择期治疗；

2、如果这种情况出现在成人身上或出现在年龄较大的孩子身上，房间隔缺损没有自愈可能，可考虑行介入封堵治疗或手术治疗。