新生儿败血症的并发症，最常见的是化脓性脑膜炎。这种孩子在诊断败血病的时候，一定要做腰穿，看脑脊液有没有被细菌感染，主要表现为白细胞有没有增高、蛋白有没有增高、糖有没有下降，如果这些都有异常的情况下，要考虑存在化脓性脑膜炎。化脓性脑膜炎做治疗的时候，抗生素可以选用透过血脑屏障的药物，而且剂量往往在败血症的治疗时候要加量，加一倍的剂量进行治疗；新生儿败血症可能并发有肺部炎症，如果有呼吸功能障碍的时候，一定要给予呼吸支持。早期可能是氧疗，其次给予无创呼吸机或者气管插管有创呼吸机给予呼吸支持；新生儿败血症可以并发骨髓炎症，如果并发骨髓炎，可能需要外科给进行会诊处理；在新生儿败血症可以并发肾盂肾炎改变，可能要对尿液进行检查，尿液里面能不能找到脓细胞，或者有没有导致肾功能损伤的情况。
