纤维支气管镜治疗肺部疾病，主要的目的有3个：

1、通过纤维支气管镜取出深部的标本，做相应的病原学检查。病原学检出的阳性率就会大大提高，如果有明确的病原，对肺炎的治疗就有针对性，可以提高内部全身用药治疗的效果；

2、通过支气管镜吸出气道内的分泌物，通过支气管肺泡灌洗术清除局部的炎症，促进肺部的恢复；

3、可以通过支气管镜局部给药，使药物在肺组织的局部的浓度增高，促进肺部炎症的愈合。