每天早上起来腰痛的原因如下：

1、人体的腰椎结构是通过肌肉、韧带、小关节、椎间盘连接，那个骨块叫做椎体。如果扭伤或者劳损，导致肌肉无力、韧带松弛、椎间盘出问题，腰椎椎体之间的稳定性会受到破坏，会出现松动甚至脱位。白天因为在活动，肌肉相对有力，保护腰椎的失稳状态，睡着时肌肉完全放松，韧带都松了，对腰椎的保护作用减小，腰椎椎体之间维持原来的位置会改变。生理弯曲变直了，没有弯曲，直接塌到床上，整个骨头变形。有些人会痛醒，半夜睡着几个小时后痛醒，有些人醒来之后觉得腰很不舒服、很酸痛，活动一下就好；

2、还有些患者腰椎有峡部裂，也会出现这个问题；

3、半夜睡的时候痛醒的病人，不但要注意这个问题，还要注意一些其它疾病，如腰椎，还有内脏其它疾病、肿瘤等。