如果是单纯性细菌性感染引起的鼻窦炎，治疗时间相对较短，而抗生素使用时间也较短，大概不会超过两周时间。如果是过敏性鼻窦炎，则其与过敏息息相关。而过敏首先与自身过敏体质有关，也与环境因素有关，以上两种因素便决定此疾病易反复发作。由于儿童鼻窦腔内较多黏液不易引流出来，且药物不易到达局部，因此其治疗时间较长，一般治疗一段时间后，孩子的症状会明显缓解。但此时其鼻窦炎的情况并未好转，患儿还需要坚持治疗，之后再动态观察其鼻窦情况。直到患儿鼻窦情况完全好转，窦腔内完全干净，才考虑其鼻窦炎已经治愈。若大部分细菌性鼻窦炎需使用抗生素，那么过敏性鼻窦炎，应进行抗敏治疗与黏液的相关引流，也可使用免疫调节剂进行调节。
