慢性咽炎多数的情况下是由于急性咽炎控制的不是特别好，迁延成慢性的咽炎。还有咽部邻近器官的炎症导致慢性咽炎。比如鼻炎、鼻窦炎，分泌物从鼻腔后端流入到咽部，反复刺激，造成慢性咽炎。还有扁桃体炎症，反复发炎导致了咽部的炎症。胃部的反流性疾病，胃酸少量的反到咽喉，造成咽部的反复不适。

所以慢性咽炎通常首先要甄别是咽部本身的慢性炎症，咽部局部的原因，还是邻近器官发炎造成。如果是邻近器官炎症或者疾病造成咽炎，将邻近器官的炎症治疗控制，慢性咽炎就可得到彻底的根治。