肿瘤标志物的生物化和免疫学特点分类以下：
1、胚胎性的抗原肿瘤标志物：胚胎性的抗原肿瘤标志物主要包括甲胎蛋白和癌胚抗原，这两种标志物在所有的体检单位当中选择是最多的，因为甲胎蛋白和癌胚抗原曾表达于正常人的胚胎的发育时期，所以这些抗原只有在胚胎时候才表达，当出生以后这些抗原就逐渐的消失。所以当这些抗原再度出现胚胎时候就要考虑是恶性的肿瘤，所以胚胎性的肿瘤标志物因此而得名，叫做癌胚性抗原肿瘤标志物；
2、糖类的抗原肿瘤标志物：糖类的抗原检测CA是由于细胞膜成分，糖蛋白当中的糖基异常而形成的抗原。正常细胞膜表面含有丰富的糖蛋白，当正常细胞转化为恶性肿瘤的时候，细胞表面的糖蛋白发生改变，形成了与正常细胞不同的特殊抗原，通常存在于肿瘤细胞的表面或者肿瘤细胞的分泌，糖类抗原也被称作癌抗原简称CA来作为代表，比如CA125、CA153、CA199、CA22，这种代码就属于癌抗原，也叫做癌抗原的简称；
3、酶类肿瘤标志物：当肿瘤发生的时候机体内一些酶的活性常常会发生较大的改变，由于不同的肿瘤其来源和影响器官不同，因此不同肿瘤所引起变化酶的种类存在差异，相关酶的检测作为肿瘤的辅助诊断，对于判断肿瘤发生的部位有重要的意义，比如PSA癌胚前列腺抗原、NSE、AFU和ALP等都是属于酶类的抗原，后两种跟肝脏肿瘤有关，第一种跟前列腺癌症有关，第二种跟非小细胞肺癌有关。由于这些抗原代表不同的部位，所以升高的时候也代表不同的肿瘤；
4、激素类的肿瘤标志物：激素类的肿瘤标志物有很多，比如人绒毛膜促性腺激素、肾上腺素、降钙素、生长激素等，但是大部分的肿瘤和激素的关系并不是固定的，有时同一种肿瘤可以分泌多种激素，有时同一种激素可以有多种的肿瘤来分泌，有些肿瘤发生的时候激素本身并不增加，而增加的是相应的激素的受体，比如乳腺癌患者雌激素和孕激素的水平并不增加或者增加的很少，但其受体的数量可以明显的增加。另外恶性肿瘤异位激素，就是在正常情况下不产生激素的细胞，恶性转化以后形成的肿瘤细胞合成和分泌的激素或者激素样的物质分泌量减少而且不恒定。目前在临床上使用较多的是人绒毛膜促性腺激素、儿茶酚胺等，比如肾上腺素是分泌型的嗜铬细胞瘤的主要标志物；
5、其他蛋白类的肿瘤标志物：正常细胞在恶性转化的过程当中，常常出现肿瘤相关基因的异常的高表达，其中分泌性的蛋白可以进入宿主的体液当中，而作为肿瘤标志物监测肿瘤的发生和发展及转归，这一类肿瘤标志物比如卵巢癌HE4标志物；
6、基因类的肿瘤标志物：癌症发生的多基因参与是癌症特别重要的特征之一，分析和确定这些基因是肿瘤诊断的关键，常见原癌基因类的肿瘤标志物，比如K-ras基因、N-ras等。
