毛发移植是通过手术来完成的，植发的副作用主要跟手术相关。手术需要麻醉，麻药有毒副作用。手术需要做切口，切口会出血。毛发移植需要打孔，范围也很大，不管是供移区还是受移区，都会有大范围的损伤。所以在植发手术中，大范围的水肿和出血是一个问题。伴随而来的感染、疤痕也不可避免。当然，通过操作者精心准备和术后正常护理，疤痕、感染、出血、水肿都是可控的。需要注意的是，在毛发单位提取过程中，如果毛囊处理不当，会在局部产生一些肉芽肿样反应，因为毛发本身也是个异物，肉芽肿样反应出现的话，可以在术后进行激光祛除，或者用一些小手术将其切除。
