患者过长包皮包裹龟头大部分、冠状沟。正常包皮内板和阴茎龟头由鳞状上皮覆盖，随上皮成熟逐渐脱落，形成脱落包皮屑在阴茎皮肤表面和包皮内板皮肤表面形成堆聚。包皮正常患者经常显露龟头补，容易清洗，因此不会形成包皮垢。
如脱落上皮过多，在局部堆积得不到清洗，排尿时有尿液存留在被包皮覆盖部分，易滋生细菌活动。包皮垢是细菌在活动和代谢分裂中很好的培养基。因此包皮垢是包皮炎、龟头炎重要因素。而且反复发作包皮炎、龟头炎，可逆行造成尿道感染甚至于前列腺和附睾炎症。因此包皮过长产生包皮垢是造成炎症的负面因素。
包皮垢是包皮过长，覆盖在龟头上形成上皮脱落，细菌活动以后产生污秽东西，不注意健康的人更容易形成包皮垢。如不注意清理包皮垢反复出现感染，会造成包皮龟头炎和尿路感染。