下面长小水疱主要原因考虑是生殖器疱疹。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒Ⅰ型或者单纯疱疹病毒Ⅱ型感染引起的性传播疾病。当然大家也不必恐慌，因为生殖器疱疹主要是通过性生活传播而导致的。发现下面长小水疱之后，首先可以去医院在医生的指导下进行初步诊断。生殖器疱疹发病比较急，局部有灼痛感，水疱迅速融合成团，疱液比较清亮。如果症状比较严重，宜尽快治疗，治疗方式以外用阿昔洛韦软膏加口服阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等抗病毒药物为主。夫妻一方诊断为生殖器疱疹病毒之后，这段时间禁止性生活，因为生殖器疱疹主要传播途径就是性传播。